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 据材料“小学读经课一律废止……中学校以完足普通教育，造成健全国民为宗旨，科目有修身、国文、外国语、地理、数学、手工、体操等”，可知南京临时政府废止了读经课，确立了普通教育的学科，顺应了南京临时政府民主共和的时代发展，故选D项；教育改革后还有国文，说明并未废止传统文化，排除A项；晚清时期近代教育体系就已经开始建立，排除B项；教育转型受到西方影响，但不是南京临时政府教育变革的本质，而是原因之一，排除C项。