A

南宋中后期宰相专权，兼管“兵政、财用”，直接行使多个机构职权，打破了正常中枢决策机制，使得决策机制出现异化，故选A项；行政运行效率并未提升，反而因权力过度集中导致腐败丛生、决策失误，材料无效率提升迹象，排除B项；三省六部制在宋朝已弱化，南宋时三省职能多归宰相，但材料焦点是宰相个人越权而非制度存废问题，排除C项；材料仅述中央宰相专权，未提地方势力，且宋朝加强中央集权，地方藩镇未膨胀，排除D项。