B

 根据所学知识，秦始皇统一全国后，为加强封建统治，创立了一套封建专制主义的中央集权制度，中央设立三公九卿，在地方上，推行郡县制。因此秦朝在地方上取代了周制的“帝国结构”指的是郡县制。分封制为西周时期政治制度，郡国并行制为汉初推行的制度，行省制首创于我国元朝。故选B。