B

 材料朱熹认为书院教育强调“忠”“孝”，陆九渊认为“求学在于求知而不在于求利”，这说明书院承担教化育人功能，故B项正确；朱、陆办学并不完全跟统治者意志相违背，也不能代表所有的书院，排除A项；材料反映朱、陆的办学思想，没有体现商品经济发展对书院的影响，排除C项；材料无法体现当时理学是否成为主流思想，排除D项。