D

根据材料并结合所学知识可知，材料中有毛泽东对宗教与信仰之间区别的思考和对公民概念及其内涵的深入探讨，  毛泽东对宪法草案条款的批语反映了他对于某些条款的深思熟虑和对相关问题的考量。这些批语不仅仅是简单的肯定或否定，而是包含了丰富的思辨性考量，故选D项；“强调文化信仰自由”主要体现第3条的信息，主要体现部分材料，排除A项；“践行社会主义原则”体现为公有制主体，以共同富裕为特点，排除B项；“保障公民合法权利”与公民享有的选举权和被选举权有关，排除C项。