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据材料“虑士子习制举业不务实学”“习天文、地舆、算术与夫通百家言者，亦与焉”可知，尚志书院意在改变士子“不务实学”的弊端，引导士子学习“天文、地舆、算术”等实用之学，对传统的办学理念进行了革新，故选B项；“动摇了”夸大化，1867年科举制还较为稳固，排除A项；“实业救国”是一些中国近代民族资产阶级主张发展资本主义工商业（即实业）作为救国救民主要途径的一种思想，丁宝桢属于地主阶级洋务派，排除C项；开启了近代中国教育改革的是1862年京师同文馆的建立，排除D项。