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根据材料内容可知，元朝在河南等地设立行省，在西藏设置宣慰使司都元帅府，由宣政院直接统辖，掌管西藏军民各项事务；在西域地区设置北庭都元帅府等管理军政事务，说明元朝统治者根据各地区的不同情况，因地制宜进行治理，故选D项；民族关系平等团结在材料中没有体现，排除A项；专制主义达到顶峰是在清朝，排除B项；边疆地区实行自治在材料中没有体现，排除C项。