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据材料及所学可知，明朝对黑龙江流域少数民族的管理不仅有设立机构、修建驿路、派遣官员巡视、建船厂等措施，还有兴建佛教寺庙，用四种文字记录经营该地事迹，体现出政府更强调对当地百姓用宗教进行教化的措施，A项“政教兼举，教化为先”思想正确，A项正确；
材料涉及宗教，未涉及儒法思想，排除B项；
材料未涉及民本思想，排除C项；
“以夷制夷，因俗而治”思想在材料没有体现，排除D项。
故选：A。
本题考查宋元至明清时期的法律与教化，要求运用所学分析解读题干信息。
本题考查宋元至明清时期的法律与教化，考查学生准确解读材料及运用所学知识解决问题的能力。