D

根据所学，1689年《权利法案》的通过，标志着确立了议会至上的原则，故A项错误；责任内阁的形成使国王行政权力的丧失，故B项错误；国王的作法没有违背《权利法案》，没有触犯议会的最高权力，故C项错误；据“他不允许议会在他去国外时开会，并很少带英国大臣到欧洲大陆去，他自己是自己的第一大臣（首相），指定他所信任的人担任要职”可知国王有独立行政的权力，故D项正确。