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新疆阿克苏的汉代大型衙署遗址出土了西域都护李崇的私印及大量汉代遗物，证明汉代在西域设置了行政机构、实施了有效管理，故选B项；材料聚焦 “西域（新疆）” 的行政遗存，未涉及汉代对匈奴的军事态势，排除A项；汉代边疆与内地存在经济、文化交流，但并未达到 “一体化” 程度，排除C项；材料中的 “西域都护”“大型衙署” 属于地区高层行政机构，并非乡、里等基层治理单位，排除D项。