C

据材料信息可知，康熙根据实际情况出发，重新诠释儒家思想，又恪守祖训，而且根据实际情况对少数民族和边疆地区实行因地制宜、因俗而治，这些措施有利于更好的巩固统一多民族国家的发展，故选C项；中国古代封建王朝的政权并不是政教合一，A项史实错误，排除A项；公元前136年，朝廷设立五经博士，儒学独尊地位确立，儒学成为我国封建社会的主流意识形态，排除B项；根据材料信息“诠释孔孟程朱之道”“恪守祖训”表明并未突破传统文化的藩篱，排除D项。