A

据材料“基层的控制权往往掌握在下层武将手中”可知，相比于东晋前期，门阀士族独立掌管军权而言，东晋后期低级士族和庶族地主势力崛起，反映了当时士族门阀势力的不断衰落，故选A项；宋代设置三衙和枢密院，实现统兵权与调兵权趋向分离，排除B项；“基层的控制权往往掌握在下层武将手中”说明当时地方武将实力不断增强，不利于加强中央集权，排除C项；士族门阀势力的衰落和庶族地主的崛起必然导致权力交替，引发社会动荡和激烈的武装冲突，排除D项。