C

据所学知，香港、澳门今天的繁荣稳定，得益于“一国两制”的实施，一国两制的基本方针实现了港澳与祖国内地优势互补，保证了香港、澳门特别行政区的繁荣、稳定和发展，C符合题意；“求同存异”方针是外交方针，排除A；民族区域自治制度是民族关系，排除B；经济特区是对外开放政策，排除D。
故选：C。
本题主要考查了澳门回归以来经济繁荣稳定发展的原因等知识，掌握相关基础知识。
本题考查学生的识记和理解能力，掌握“一国两制”的构想及港澳回归的相关知识。