D

英国作为老牌殖民国家，虽然其在华公司绝对数量仍在增长，但由于其他列强的公司数量增加更快，导致英国在华公司比重相对下降，导致1895—1909年英国在华公司比重下降的核心原因是垄断资本主义的形成，它引发了列强在华的经济竞争，使英国相对份额被稀释，故选D项；义和团运动（1899—1901）等反帝运动，确实对列强在华势力造成冲击，但运动主要针对所有外国势力，并非专门针对英国，且义和团被镇压后，1901年《辛丑条约》反而强化了列强特权，外国公司总数继续增加，排除A项；中国民族企业的发展主要是在国内市场与外国企业竞争，重点是在轻工业等领域，对英国在华公司数占外国在华公司总数比重的直接影响较小，不是导致该比重变化的主要原因，排除B项；英国经济结构调整主要是国内产业结构的变化，如向服务业、重工业等转型，这与英国在华公司数占外国在华公司总数比重的变化没有直接关联，排除C项。