A

据材料信息并结合所学可知，石家河城遗址位于湖北省天门市石家河镇，地处江汉平原北部与大洪山南麓结合处的山前地带，是长江中游地区面积最大、延续时间最长、等级最高、附属聚落最多的史前城址聚落，是长江中游地区新石器时代晚期的文明中心，且其历史可追溯到距今约6000年至4000年，与题目中描述的时间段相符，故选A项；二里头遗址位于黄河流域，空间位置与材料不符，排除B项；良渚遗址位于长江下游，空间位置与材料不符，排除C项；牛河梁遗址位于辽河流域，空间位置与材料不符，排除D项。