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据材料“如遇海疆有事，敌船以旱队猝登，隔绝南北声气，内外夹击，危迫将不忍言”可知刘铭传认为海上存在危险隐患，“若修铁路既成，调兵极便，何处有警，瞬息长驱”如果兴办铁路的话则有利于海上的军事防御，因此主张兴办铁路，故选D项；材料分析的是台湾的地理位置和其军事意义，并未直接建议在台湾设省，排除A项；材料没有明确指出敌船指的是日本，且近代日本侵华是在19世纪90年代，排除B项；“若修铁路既成”强调的是修铁路而非加强海军建设，排除C项。