B

根据材料可知，纳吐夫遗址文明遗址中发现了农作物、家畜和农业工具，而且“谷物遗存都是大麦、小麦之类的野生品种，”“野山羊骨几乎占了全部兽骨的76%。”，由此可知，当时人们对作物和动物品种有认识和选择，B项正确；遗址中的遗存仅能说明人们有农业生产活动，但不能说明“初步发展”，排除A项；材料没有关于产量、存储等与剩余产品相关的信息，排除C项；材料仅为纳吐夫遗址一处遗址，没有涉及各地农业文明的传播来源，不能得出“各地农业文明由两河流域传播而来”的结论，排除D项。
故选B。
本题要求学生阅读史料并结合所学作出回答。
本题要求学生具有解读材料信息，调动和运用知识分析历史问题的能力。