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雍正上谕指出云贵川广土司“肆为不法”“扰害地方”，改土归流后设流官、编户籍、征赋税，使边地“渐同内地”，其核心在于以流官取代土司、纳入王朝直接行政体系，强化中央对西南边疆的管控，故D项正确。A：程度绝对化，“彻底根除”民族矛盾表述绝对化，改土归流只能缓解冲突，无法根除民族矛盾。B：史实谬误，材料明确“征赋税”，而非废除赋税制度，与史实相反。C：无中生有，材料只涉及改土归流、设流官、编户籍，未提及边疆民族向外迁徙。