D

据“八千多年前”可知，题干背景属于新石器时代。“沟壑纵横”不方便船只穿行，与“5.6米长的残躯”不符，故①错误；草原连绵，与独木扁舟没有关系，故②错误；据“用它5.6米长的残躯”可知，该地当时水域宽广，故③正确；据“一叶独木扁舟”可知，当时植被茂盛，故④正确，选择D项符合题意。