C

试题分析：A、B两项中的“文艺复兴”和“宗教改革”均以人文主义为指导思想，与题目中的信息“理性”不符，故排除；题目中的信息“他们摆脱了对上帝的恐惧……但是仍然相信宇宙是上帝按照理性计划设计的完美结合的机器”反映了启蒙运动期间反对教权主义和倡导理性主义的思想，故C项表述正确；D项中的“进化论”有力地挑战了封建神学创世说，与题目中的信息“他们仍然相信宇宙是上帝按照理性计划设计的完美结合的机器”不符，故排除。