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根据所学知识可知，中共十一届三中全会后，中国迈出了对外开放的步伐。1980年，中央决定在广东、福建两省兴办深圳、珠海、汕头、厦门4个经济特区，实行特殊的经济政策和经济管理体制，允许外国企业或个人以及华侨、港澳同胞进行投资活动，并在进出口、减免税等方面提供优惠条件。这一崭新的试验很快取得明显成就。深圳在短短的几年内，建设成为一座繁华的现代化城市，成为经济特区的代表和对外开放的“窗口”。据此可知，“深圳奇迹”主要得益于对外开放、经济特区政策的实行，C项正确；地理位置的优越是深圳成为首批经济特区的原因，但它不是“深圳奇迹”出现的主要原因，排除A项；我国计划经济体制形成于三大改造的完成，且长期高度集中的计划经济体制出现严重弊端，阻碍了生产力发展，排除B项；科学技术的进步是促进经济发展的原因之一，但不是“深圳奇迹”出现的主要原因，排除D项。故选C项。